Действие романа «Ветры Дюны» происходит между книгами «канонической» части саги – «Мессия Дюны» и «Дети Дюны».
Ослепший Пол Муад`Диб исчез в пустыне, оставив Империю своей шестнадцатилетней сестре. Фанатичная принцесса-воительница Алия, ставшая регентом при близнецах, рожденных от Пола его возлюбленной Чани, пытается управлять Империей при помощи беззаветно преданного ей Дункана Айдахо. Вдовствующая императрица Ирулан под давлением Алии продолжает свой труд по обожествлению Муад`Диба.
В это сложное время с Каладана возвращаются на Дюну Джессика и Гарни Холлик…