Благодаря канистре таинственного вещества и чудесному стечению обстоятельств четыре маленьких черепашки и ручная крыса Сплинтер мутировали в разумных человекоподобных существ. Сплинтер стал наставником и отцом юных черепашек, обучил их искусству ниндзюцу и дал им имена: Леонардо, Рафаэль, Микеланджело и Донателло. .После разрешения конфликта с Кланом «Фут» Черепахи пытаются найти своё место в жизни, и эти поиски вновь разделяют семью - ведь, пожалуй, пришло время жить самостоятельно. Между тем, старый враг, о котором все забыли, ищет возмездия, и его могучая поступь всё ближе! . .